Определение истинного пола у пациента в каждом конкретном случае способствует своевременному и правильному установлению диагноза, а при необходимости — изменению пола в нужном направлении. Сходство фенотипа при большинстве интерсексуальных состояний с фенотипом нормальной женщины (особенно в строении наружных половых органов) способствует успешной схеме пола в женском направлении. Заместительная циклическая терапия женскими половыми гормонами в дальнейшем приводит к появлению менструаций и развитию вторичных женских половых признаков. Ткань гонад в таких случаях подлежит хирургическому удалению ввиду ее тенденции к злокачественному перерождению. Смена пола на мужской представляет значительные трудности ввиду того, что в постэмбриональном периоде добиться значительной вирилизации не удается.

При синдроме Клайнфельтера показана как заместительная терапия мужскими половыми гормонами, так и стимуляция гонадотропином на фоне дачи андрогенных препаратов. Гинекомастия подлежит хирургическому удалению ввиду тенденции ткани молочной железы к злокачественному перерождению.