Данные в отношении репликации Y-хромосомы противоречивы. Согласно одним исследованиям, в культуре лейкоцитов периферической крови она заканчивает репликацию рано, одновременно с комплексом аутосом (Моrishima и др., 1962; Grumbach и др., 1963). Однако другие цитогенетики для того же типа клеток описывают Y-хромосому как наиболее позднего репликанта у мужчин (German, 1964; Rikuchi, Sandberg, 1964; Schmid, 1963; Takagi and Sandberg, 1968).

При исследовании репродукции хромосом в культуре фибробластов кожи (Atkins, Gustavson, 1964) и в первичной культуре эмориональных фибробластов (С. И. Слезингер и А. А. Нрокофьева-Бельговская, 1967) Y-хромосома обнаружена как поздно реплицирующаяся хромосома.

Gavosto исследовал репликацию хромосом in vivo у пациента с острой лейкемией и обнаружил, что как в эуплоидных, так и в анэуплоидных метафазах в конце периода синтеза включение тимидина-Н³ наиболее интенсивно в Y-хромосому (Gavosto и др., 1963).